Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms