Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifi35Q9D8C4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms