Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn9Q9D805 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms