Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Slx4ipQ9D7Y9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms