Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms