Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbe1Q9D6Y9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms