Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms