Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms