Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syce1Q9D495 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syce1Q9D495 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms