Protein–RNA interactions for Protein: Q9D485

Efhc2, EF-hand domain-containing family member C2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc2Q9D485 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Efhc2Q9D485 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms