Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snx29Q9D3S3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms