Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms