Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1L0

Chchd2, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd2Q9D1L0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd2Q9D1L0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms