Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SarnpQ9D1J3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms