Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc5Q9D0F6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rfc5Q9D0F6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfc5Q9D0F6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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