Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms