Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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