Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nde1Q9CZA6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms