Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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