Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms