Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Exo5Q9CXP9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms