Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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