Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Utp23Q9CX11 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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