Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms