Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX9

Ddx47, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx47Q9CWX9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx47Q9CWX9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms