Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rpusd4Q9CWX4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rpusd4Q9CWX4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rpusd4Q9CWX4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rpusd4Q9CWX4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rpusd4Q9CWX4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rpusd4Q9CWX4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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