Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cxxc1Q9CWW7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms