Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK8

Snx2, Sorting nexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx2Q9CWK8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms