Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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