Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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