Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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