Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rprd1bQ9CSU0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms