Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms