Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9CRC3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CRC3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CRC3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9CRC3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9CRC3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9CRC3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9CRC3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9CRC3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9CRC3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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