Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms