Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PompQ9CQT5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PompQ9CQT5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PompQ9CQT5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PompQ9CQT5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PompQ9CQT5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PompQ9CQT5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PompQ9CQT5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PompQ9CQT5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms