Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms