Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1bQ9CQC9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1bQ9CQC9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1bQ9CQC9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1bQ9CQC9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1bQ9CQC9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1bQ9CQC9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1bQ9CQC9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1bQ9CQC9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1bQ9CQC9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1bQ9CQC9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1bQ9CQC9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1bQ9CQC9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1bQ9CQC9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1bQ9CQC9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1bQ9CQC9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1bQ9CQC9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1bQ9CQC9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1bQ9CQC9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1bQ9CQC9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1bQ9CQC9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1bQ9CQC9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1bQ9CQC9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1bQ9CQC9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1bQ9CQC9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1bQ9CQC9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1bQ9CQC9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1bQ9CQC9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1bQ9CQC9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sar1bQ9CQC9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sar1bQ9CQC9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sar1bQ9CQC9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sar1bQ9CQC9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sar1bQ9CQC9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms