Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms