Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms