Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms