Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms