Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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