Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms