Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup155Q99P88 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup155Q99P88 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup155Q99P88 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup155Q99P88 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup155Q99P88 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup155Q99P88 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup155Q99P88 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup155Q99P88 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup155Q99P88 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup155Q99P88 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup155Q99P88 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup155Q99P88 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup155Q99P88 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms