Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b1Q99NB9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms