Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrrtQ99MR6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms