Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp1b4Q99ME6 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms