Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprtQ99M80 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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