Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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